長鏈非編碼RNA（long noncoding RNA, lncRNA）是一類廣泛存在于生物體內(nèi)、長度超過200 nt、不編碼蛋白的RNA。lncRNA在表觀遺傳學、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后等多種水平調(diào)控基因表達、疾病的病理生理過程中起著重要的調(diào)節(jié)作用。
lncRNA高通量測序，采用去核糖體建庫方法，對長鏈非編碼RNA等大RNA進行測序研究，從而快速全面準確地獲得與特定生物學過程（例如發(fā)育、疾病等）所有大RNA轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)信息，結(jié)果更全面，可應(yīng)用于細胞分化和發(fā)育的研究、調(diào)控機理的研究、疾病標志物的尋找、疾病的分子診斷、基因藥物的研發(fā)等。
lncRNA分析內(nèi)容
基本分析
高級分析
原始數(shù)據(jù)質(zhì)控及評估
與mRNA關(guān)聯(lián)分析
lcnRNA表達水平分析
lncRNA靶基因預(yù)測
lcnRNA差異表達分析
個性化分析
GO和KEGG富集分析
新lcnRNA預(yù)測
Long non-coding RNAs control hematopoietic stem cell function
長鏈非編碼RNA可調(diào)控造血干細胞功能
LncRNA是基因表達的重要調(diào)節(jié)因子，但lncRNA在造血干細胞的功能不清楚。研究人員通過對造血干細胞轉(zhuǎn)錄組進行深度測序，鑒定出了323個未注釋的lncRNA，通過比較已分化的細胞譜系中的表達，鑒定出了159個lncRNAs富集在造血干細胞中，其中一些可能是HSC特異性的。這些lncRNA基因與蛋白編碼基因具有相同的表觀遺傳特征，包括通過DNA甲基化調(diào)控表達，敲除掉兩個lncHSCs——lncHSC-1和lncHSC-2，對HSC自我更新和譜系決定具有不同的影響。這些結(jié)果表明，lncRNA在調(diào)控造血干細胞功能方面，起著重要的作用。
Luo M , Jeong M , Sun D , et al. Long Non-Coding RNAs Control Hematopoietic Stem Cell Function[J]. Cell Stem Cell, 2015, 16(4):426-438.
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